News of Kazakhstan Science
Новости науки Казахстана
научно – технический журнал (ISSN 1560-5655)
МРНТИ 34.25.37 №4 (2017г.)
Аннотация. Из клоакального смыва лебедя-кликуна, отловленного в Северо-Казахстанской области, выделен гемагглютинирующий агент, идентификация которого в реакции торможения гемагглютинирующей активности с набором диагностических сывороток, секвенирования фрагмента L- гена продуктов полимеразной цепной реакциии, а также секвенирования полного генома, что позволило отнести новый изолят к парамиксовирусу серотипа 8. Цель исследований - изучение биологических, антигенных и молекулярно-генетических свойств нового штамма, рекомендуемого в качестве диагностического препарата при индикации возбудителей ПМВ-8 инфекций у птиц. В результате молекулярно-генетического анализе штамма ПМВ-8/лебедь-кликун/СКО/5767/13 выявлены уникальные нуклеотидные замены в позициях 716 и 1610 F-гена, которые привели к аминокислотным заменам K239R и T537M, отличающим новый казахстанский штамм от эталонного и ранее известных вариантов этого серотипа. Показано, что функционально активные сайты расщепления белка слияния F штамма имеют в своем составе аминокислотную последовательность TYPQTR↓L, характерную для слабопатогенных вирусов. Штамм ПМВ-8лебедь-кликун/СКО/5767/2013 рекомендуется использовать для приготовления специфического антигена и иммунной сыворотки с целью индикации возбудителя инфекции и противовирусных антител к нему. Ключевые слова: штамм, парамиксовирус, серотип 8, иммунная сыворотка, филогенетический анализ, диагностикум, дикая птица, диагностические препараты.
Сейдалина а.Б., Даулбаева К.Д., Қыдырманов а.и., Қарамендин к.Ө., Асанова с.е., Саятов М.Х., Хан Е.Я., Қасымбеков е.т., Жұматов К.Х. БАЛАУЛЫҚ ПРЕПАРАТТАР ДАЙЫНДАУ ҮШІН ҚОЛДАНЫЛАТЫН ҚҰС ПАРАМИКСОВИРУСЫНЫҢ 8 – СЕРОТИПІНІҢ СҰҢҚЫЛДАҚ АҚҚУ/СОЛТҮСТІК ҚАЗАҚСТАН/5767/2013 ШТАМЫ
Аңдатпа Солтүстік Қазақстан аулап алынған сұңқылдақ аққудың клоака шайындысынан гемагглютинденуші агент бөлінді, оны гемагглютинденушілік белсенділігін диогностикалық қан сарысуы жиынтығымен тежеу, полимеразды тізбектік реакция өнімдерінің L-генінің фрагменті мен толық геномының секвенделуі реакциясындағы уі жаңа излолятты парамиксовирустың 8-серотипіне жатқызуға мүмкіндік берді. Зерттеулердің мақсаты - құстардағы ПМВ-8 инфекциялардың қоздырғыштарын индикациялау кезінде диагностикалық препарат ретінде ұсынылатын жаңа штаммтың биологиялық, антигендік және молекулярлық-генетикалық қасиеттерін зерттеу. ПМВ-8/сұңқылдақ аққу/СҚО/5767/2013 штамын молекулярно-генетикалық талдау нәтижесінде F- генінің 716 және 1610 позицияларында бірегей нуклеотидтік орын ауысулар анықталды. Ол өз кезегінде қазақстандық жаңа штамның осы серотиптің эталондық және бұрыннан белгілі нұсқаларынан айрықшаландыратын K239R мен T537M аминқышқылдық ауысымдарға алып келді. F штамының қосылу ақуызының ажырау функционалды белсенді сайттарының құрамында жұғымталдығы әлсіз потагендік вирустарға тән TYPQTR↓L аминқышқылдық тізбектердің бар екні көрсетілді. ПМВ-8/Сұңқылдақ аққу/СҚ/5767/2013 штамын инфекция қоздырушысын және оған қарсы тұратын індетке қарсы антиденелерді айғақтау мақсатында айрықша антиген мен иммундық қан сарысуын дайындау үшін қолдануға ұсынылады. Түйінді сөздер: штамм, парамиксовирус, 8-серотип, иммундық қан сары суы, филогенетикалық талдау, диагностикум, жабайы құс, диагностикалық препараттар.
Seidalina а.B., Daulbaeva K.D., Kydyrmanov а.I., кaramendin к.о., Asanovа S.е.,. Sаytоv М.Kh, Khаn Е.Yа., Каsymbekov е.т., Zhumatov К. Kh. NEW STRAIN OF AVIAN PARAMYXOVIRUS SEROTYPE 8 WHOOPER SWAN/NORTHERN KAZAKHSTAN/5767/2013, USED FOR PREPARATION OF DIAGNOSTIC PREPARATIONS
Abstract. In October 2013, a hemagglutinating agent was isolated From cloacal swab of whooper swan caught in the Northern Kazakhstan region, identification of which in the hemagglutination inhibition assay of response inhibition hemagglutinine activity (HI) with a set of diagnostic sera, sequencing of the L-gene fragment, and sequencing of the complete genome, allowed to attribute this isolate to avian paramyxovirus serotype 8. The purpose of the research is the study of the biological, antigenic and molecular properties of a new strain is recommended as a diagnostic drug for indication of pathogens PMA-8 infections in birds. Molecular-genetic analysis of the APMV-8/whooper swan/Northern Kazakhstan/5767/2013 strain revealed unique nucleotide substitutions at positions 716 and 1610 of the F gene, which led to the amino acid substitutions K239R and T537M, distinguishing the new Kazakhstan strain from the reference and previous variants of this serotype. It has been shown that the functionally active cleavage sites of fusion protein F of APMV-8/whooper swan/Northern Kazakhstan/5767/2013 have a TYPQTR↓L amino acid sequence that characterize low pathogenic viruses. The strain PMV-8 whooper swan / RMS / 5767/2013 is recommended for the preparation of a specific antigen and immune serum for indication of an infectious agent and antiviral antibodies to it. Key words: strain, serotype 8, paramyxovirus, immune serum, phylogenetic analysis, diagnosticum, wild bird, diagnostic preparations.